Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF408Q9H9D4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms