Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf88Q9H8K7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C10orf88Q9H8K7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C10orf88Q9H8K7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C10orf88Q9H8K7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf88Q9H8K7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf88Q9H8K7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf88Q9H8K7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf88Q9H8K7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf88Q9H8K7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf88Q9H8K7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf88Q9H8K7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf88Q9H8K7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf88Q9H8K7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf88Q9H8K7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf88Q9H8K7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf88Q9H8K7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf88Q9H8K7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C10orf88Q9H8K7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf88Q9H8K7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf88Q9H8K7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf88Q9H8K7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf88Q9H8K7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf88Q9H8K7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms