Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NRDE2Q9H7Z3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NRDE2Q9H7Z3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms