Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TDRD3Q9H7E2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TDRD3Q9H7E2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms