Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC86Q9H6F5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC86Q9H6F5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC86Q9H6F5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC86Q9H6F5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC86Q9H6F5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC86Q9H6F5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC86Q9H6F5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC86Q9H6F5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC86Q9H6F5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC86Q9H6F5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC86Q9H6F5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC86Q9H6F5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC86Q9H6F5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC86Q9H6F5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC86Q9H6F5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms