Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CLMPQ9H6B4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms