Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDM12Q9H4Q4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms