Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HIPK3Q9H422 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms