Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA6BQ9H3T3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6BQ9H3T3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms