Protein–RNA interactions for Protein: Q9H269

VPS16, Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS16Q9H269 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS16Q9H269 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
VPS16Q9H269 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS16Q9H269 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS16Q9H269 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS16Q9H269 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS16Q9H269 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS16Q9H269 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS16Q9H269 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS16Q9H269 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS16Q9H269 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS16Q9H269 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VPS16Q9H269 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms