Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SDCBP2Q9H190 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SDCBP2Q9H190 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms