Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC8Q9H0W5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms