Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC22A4Q9H015 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms