Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GFRA4Q9GZZ7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms