Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM39BQ9GZU3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM39BQ9GZU3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms