Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDGFDQ9GZP0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PDGFDQ9GZP0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PDGFDQ9GZP0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PDGFDQ9GZP0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PDGFDQ9GZP0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDGFDQ9GZP0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDGFDQ9GZP0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDGFDQ9GZP0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDGFDQ9GZP0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDGFDQ9GZP0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDGFDQ9GZP0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDGFDQ9GZP0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDGFDQ9GZP0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PDGFDQ9GZP0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDGFDQ9GZP0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDGFDQ9GZP0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms