Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPR88Q9GZN0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR88Q9GZN0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR88Q9GZN0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR88Q9GZN0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR88Q9GZN0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR88Q9GZN0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR88Q9GZN0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR88Q9GZN0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR88Q9GZN0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR88Q9GZN0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR88Q9GZN0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR88Q9GZN0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR88Q9GZN0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR88Q9GZN0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR88Q9GZN0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR88Q9GZN0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPR88Q9GZN0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR88Q9GZN0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR88Q9GZN0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR88Q9GZN0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR88Q9GZN0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR88Q9GZN0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPR88Q9GZN0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms