Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CEP44Q9C0F1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CEP44Q9C0F1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms