Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CIPCQ9C0C6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CIPCQ9C0C6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms