Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIFKQ9BYG3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIFKQ9BYG3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms