Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PCGF6Q9BYE7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PCGF6Q9BYE7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PCGF6Q9BYE7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms