Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTRT3Q9BYD9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTRT3Q9BYD9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTRT3Q9BYD9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTRT3Q9BYD9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTRT3Q9BYD9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTRT3Q9BYD9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTRT3Q9BYD9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTRT3Q9BYD9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTRT3Q9BYD9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTRT3Q9BYD9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTRT3Q9BYD9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTRT3Q9BYD9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTRT3Q9BYD9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTRT3Q9BYD9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTRT3Q9BYD9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTRT3Q9BYD9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTRT3Q9BYD9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms