Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL25A1Q9BXS0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms