Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-6Q9BXR3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-6Q9BXR3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-6Q9BXR3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-6Q9BXR3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-6Q9BXR3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-6Q9BXR3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-6Q9BXR3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-6Q9BXR3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-6Q9BXR3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-6Q9BXR3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-6Q9BXR3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-6Q9BXR3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-6Q9BXR3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-6Q9BXR3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-6Q9BXR3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-6Q9BXR3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-6Q9BXR3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-6Q9BXR3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-6Q9BXR3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms