Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms