Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ3

C1QTNF4, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF4Q9BXJ3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF4Q9BXJ3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF4Q9BXJ3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms