Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SMIM2Q9BVW6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SMIM2Q9BVW6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms