Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VAMP8Q9BV40 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms