Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUH8

BEGAIN, Brain-enriched guanylate kinase-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEGAINQ9BUH8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BEGAINQ9BUH8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms