Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP7

FDXACB1, Ferredoxin-fold anticodon-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDXACB1Q9BRP7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FDXACB1Q9BRP7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FDXACB1Q9BRP7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FDXACB1Q9BRP7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FDXACB1Q9BRP7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FDXACB1Q9BRP7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FDXACB1Q9BRP7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FDXACB1Q9BRP7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FDXACB1Q9BRP7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDXACB1Q9BRP7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDXACB1Q9BRP7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDXACB1Q9BRP7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDXACB1Q9BRP7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDXACB1Q9BRP7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDXACB1Q9BRP7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDXACB1Q9BRP7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDXACB1Q9BRP7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDXACB1Q9BRP7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDXACB1Q9BRP7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDXACB1Q9BRP7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDXACB1Q9BRP7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDXACB1Q9BRP7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FDXACB1Q9BRP7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms