Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TXNDC17Q9BRA2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TXNDC17Q9BRA2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms