Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYD88Q99836 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYD88Q99836 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms