Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK5RAP2Q96SN8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK5RAP2Q96SN8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms