Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR1

TWNK, Twinkle protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWNKQ96RR1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWNKQ96RR1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWNKQ96RR1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms