Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALS2CR12Q96Q35 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALS2CR12Q96Q35 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms