Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNGAP1Q96PV0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNGAP1Q96PV0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms