Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC7Q96NW7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRC7Q96NW7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms