Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TSNARE1Q96NA8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TSNARE1Q96NA8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms