Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC17Q96LX7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC17Q96LX7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms