Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
LINC00208Q96KT6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms