Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEURL4Q96JN8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEURL4Q96JN8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEURL4Q96JN8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEURL4Q96JN8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
NEURL4Q96JN8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEURL4Q96JN8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEURL4Q96JN8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEURL4Q96JN8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEURL4Q96JN8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEURL4Q96JN8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEURL4Q96JN8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEURL4Q96JN8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEURL4Q96JN8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEURL4Q96JN8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEURL4Q96JN8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NEURL4Q96JN8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEURL4Q96JN8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms