Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC136Q96JN2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC136Q96JN2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms