Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC11Q96J66 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC11Q96J66 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms