Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MS4A3Q96HJ5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms