Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPNQ96H22 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPNQ96H22 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms