Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX27Q96GQ7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX27Q96GQ7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms