Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NXNL1Q96CM4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NXNL1Q96CM4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms