Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4CQ96CF2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP4CQ96CF2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms