Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LRRC59Q96AG4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC59Q96AG4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LRRC59Q96AG4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms