Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPTSSAQ969W0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SPTSSAQ969W0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms